Католический участок расположен в юго-западной части кладбища и занимает ок. 3 га. От православного был отделен валом и рвом, а с запада имел отдельный вход. Отведен участок в 50-е годы XIX века. Здесь погребены потомки А.С. Пушкина, семья врача Смидович, семья аптекаря Белявского, архитектор и автор проекта кладбищенской стены Л.Э. Скавронский.
Надгробия здесь отличаются сдержанностью украшений, что характерно для лютеран, чья вера ценила скромность и сдержанность в быте и поведении. Здесь преобладают обелиски и стелы. Надписи выполнены как латиницей, так и кириллицей. В годы Великой Отечественной войны эта часть кладбища подвергалась актам вандализма. Множество обелисков с этого участка можно увидеть на могилах ветеранов войны. На некоторых даже не сбиты первоначальные тексты.
